اسلاید زیست استاد قاسمی :
+ نوشته شده در ۱۳۸۸/۰۷/۱۶ ساعت 21:13 توسط میترا
|
سلام
قابل توجه بچه هایی که روزیکشنبه(12/7/88)سرکلاس بیوشیمی نبودند.
کوفاکتورها:بخش غیرپروتئینی که حتما بایدحضور داشته باشدتاپروتئین بتواند عملکرد خودراانجام دهد.
بدن انسان نمیتواند ویتامین های مورد نیاز خودرابسازد باستثنای ویتامین B3(نیاسین)ولیپوآمید.بدن این موادرا ازمحیط بیرون جذب میکند.
کوفاکتورها به دودسته آلی ومعدنی تقسیم میشوند.
کوفاکتورهای آلی شامل کوآنزیم ها میباشند کوآنزیم ها خود به دو گروه (پروستیک وکوآنزیم آزاد تقسیم میشود)
اگراتصال مولکولها درکوآنزیم ها خیلی محکم باشد به طوری که پس از اتصال ازهم جدا نشوند نام آنهارا پروستیک مینامند واگرمولکولها اتصال محکمی نداشته باشند وپس ازاتصال ازهم جدا شوند کوآنزیم آزاد نامیده میشود.
پروستیک ها شامل FMN(فلادین مونو نوکلئوتید)وfad(فلادین آدنین دی نوکلئوتید)در ریبوفلاور پروتئین ها میباشد هم چنین این گروه(پروستیک ها)درگروه هم هموگلوبین نیز میباشد.
کوآنزیم آزاد شامل NAD+وNADP+در آنزیم های دهیدروژناز یا آنزیم اکسیژناز میباشد.اکثر کوآنزیم ها ویتامین ها هستند.
برخی از ویتامین ها نقش هورمونی دارند .هورمون یک پیامبر شیمیایی است که توسط یک سلول ترشح میشود از طریق خون به سلول هدف میرسد.یکی از خصوصیات هورمونها این است که درحد نانوگرم ترشح میشود.
سلول هدف باید گیرنده هورمون راکه پروتئینی است را بر روی سطح خود داشته باشد.اگر این گیرنده برروی سطح سلول باشد آب دوست واگردرون سلول باشد چربی دوست است(هورمونهای چربی دوست گیرنده درون سلولی دارند ودررونویسی ژنهای خاص دخالت دارند این هورمونها درچربی حل میشوند)
پروتئینها به سه شکل:1-ساختاری مثل کلاژن2-عملکردی مثل هموگلوبین و آنتی بادی ها 3-آنزیمی مثل DNAپلی مراز میباشند.
دسته بندی ویتامین ها:
1- ویتامین های آب دوست:این ویتامین ها کاملا نقش آنزیمی دارند ودارای پیوند دوگانه برروی کربن 12وپیوند سه گانه برروی کربن15 میباشدواین پیوندها ازنوع سیس میباشد مثال های این گروه شامل ویتامین C( یااسیدآسکوربیک که از قند گلوگز مشتق میشود )و ویتامین گروه B(بیکمپلکس) میباشد.
ویتامین های گروه B:B1 B2 B3 B5 B6 B8 B9 B12 میباشد.
ویتامین ها دربدن انسان دچار تغییراتی میشوند وبه صورت فعال وکوآنزیمی درمی آیند.
نام کوآنزیمی ویتامین گروه B:
B1:تیامین پروفسفات (TPP)
B2:شامل دوگروه 1-FAD(ریبوفلادین آدنین دی نوکلئوتید)
2-FMN(ریبوفلادین مونو نوکلئوتید)
B3:نیکوتین آمید آدنین دی نوکلئوتید NAD+/NADP+
B5:پنتوتنیک اسی که کوآنزیم Aنامیده میشود وبا علامت اختصاری COAنمایش داده میشود.
B6:شامل سه شکل :1-پریدوکسال فسفات PLP(از دو دیگر در بدن فعال تر است)
2-پریدوکسامین فسفات
3-پریدوکسین فسفات
B8:بیوتین
B9:فولیک اسیدوتتراهیدروفولات که مخفف آن THFمیباشد.
B12:هیدروکسی کبالدین
ویتامین های آب دوست درنهایت به پروستوگلاندینها تبدیل میشوند که نقش ایمنی یا ایمونولوژیک دارندویکی از نقشهای آن جلوگیری از ترشح H+ به معده میباشد.
2- ویتامین های چربی دوست: این ویتامین ها از روغن های گیاهی مثل آفتابگردان وزیتون گرفته میشوند. این ویتامین ها در بدن ابتدا به آراشیدونیک اسید20کربنه وسپس به پروستوگلانیدها تبدیل میشود. ویتامین های چربی دوست شامل(A D F K E)میباشد.
ویتامین AوDنقش هورمونی دارند(گیرنده داخل هسته) میباشدوبر همین اساس بر DNAاثر میگذارد اما ویتامین های E F Kبر آنزیمها اثر میگذارندونقش کوآنزیمی دارند.
ویتامین Aاز بتا کارتن مشتق میشود (بتا کارتن ترکیبات رنگی گیاهی هستندو40کربنه میباشند)
طرز قرار گرفتن کارتن ها به صورت(α-کارتن β-کارتن γ-کارتن)میباشد.
درکارتن پیوند دوگانه موجود باعث ایجاد ایزومر هندسی سیس وترانس میشود.پیوند دوگانه اغلب از نوع ترانس است.
حلت فعال ویتامین Aشامل:1-آل ترانس رتینول
2-آل سیس رتینالدهید
3-رتینوئیک اسید
مورد1و2در گیرنده های بینایی حضور دارند ومورد 3نقش هورمونی دارد.
ویتامین Aدر رشدو تمایز سلولها وشکل دهی جنین نقش دارد.این ویتامین دربدن ذخیره میشود وبرحسب نیاز به سلول هدف برده میشود. چون این ویتامین محلول در آب نیست توسط پروتئین های حامل به سمت سلول هدف برده میشود.
درسیستم گوارش ویتامین بتا-کارتن جذب میشود سپس در سلول روده بتا-کارتن توسط آنزیمی به نام اکسیژناز میشکند وتبدیل به ترانس رتینالدهید میشود وبعد به ترانس رتینول تبدیل میشود وبعد از آن استری میشود وهمراه ذرات لیپو پروتئین به نام شیلو میکرونها به سمت کبد برده میشود.
واکنش استری شدن:وقتی یک الکل بایک گروه کربکسیل پیوند میدهد وآب تولید میکند ترکیب حاصل استری میشود.
پایان
توصیه استاد:
میتونید از کتاب بیوشیمی شهبازی ملک نیا در مورد کوفاکتورها و ویتامین ها کمک بگیرید این مطالب به طور کامل در این کتاب توضیح داده شده است.
+ نوشته شده در ۱۳۸۸/۰۷/۱۵ ساعت 9:26 توسط المیرا
|
سلام بچه ها:
اگه یادتون باشه چهارشنبه استادفراشاهی سرکلاس آز زسیت درمورد( تکنیک pcr) توضیح داد من که سر کلاس خوب متوجه نشدم برای همین ازاینترنت مطالبی روپیدا کردم که خیلی بهمکمک کرد .
حالا منم خلاصه ای ازاین مطالبو تو این وب میذارم امیدوارم براتون مفید باشه.
تکنیک pcr: polymeras chain reaction (واکنشهای زنجیره ای پلیمراز )
Pcr تکنیکی است برای تکثیریک توالی خاص ازژن یک موجود زنده که مورداستفاده قرارمیگیرد.
پرایمرها:برای انجام عمل pcrنیازبه پرایمرها داریم.پرایمرهای pcrبه صورت کاملا اختصاصی و مکمل ناحیه موردنظرDNAهدف طراحی قرارمیگیرند.پرایمرها 20تا30باز دارند. نرم افزارهایی وجود دارندکه طراحی پرایمرها رابرعهده دارند.
برای طراحی پرایمرها توالی نوکلوئیدی موردنظرچند موجودزنده رابایکدیگر مقایسه می کنیم ونوکلئوتیدی که ازهمه بیشتراست رانوکلوئوتیدپرایمر انتخاب می کنیم. اگرهرچندبازی که باهم
مقایسه میکنیم مثل هم باشدبازی راکه با همه بازهای درحال مقایسه مطابقت دارد انتخاب میکنیم.
اگرژن موردنظرما دردسترس نباشد ازروی اینترنت ژنی مشابه ژنی که میخواهیم استخراج میکنیم واز روی آن ژن پرایمر راتهیه میکنیم. در pcrچون دورشته DNAداریم دونوع پرایمرنیز مورد استفاده قرارمیگیرد.
عمل پرایمرها:1-عمل ژنی که باید تکثیرشودرامشخص میکند.
2-اندازه قطعات تکثیرشونده راتعیین میکند.
درمودرگزینه دوم به این صورت میباشدکه وقتی دوشته پرایمر به دوناحیه مختلف DNAوبه سمت هم قرار میگیرند DNAپلی مراز قطغاتی راکه بین این دوقراردارند همانندسازی میکنند وبدین ترتیب طول قطعات ساخته شده تعیین میشود.
نحوه عملکرد pcr:برای انجام این تکنیک DNAالگو پرایمرها ونوکلئوتید تری فسفاتها وDNAپلی مراز رادریک لوله باهم مخلوط میکنیم.
درpcr3مرحله اساسی وجوددارد:
1-denaturation :دراین مرحله باگرم کردن لوله تادمای 94درجه به مدت 20تا30ثانیهدورشته ی DNAالگو وپرایمرها ازیکدیگرجدا میشوند این جداشدن ازطریق ازبین رفتن باندهای هیدروژنی بین نوکلئوتیدهای دورشته DNAالگو وپرایمرها صورت میگیرد.
2-anneling: دراین مرحله دمای واکنش به 50تا60درجه به مدت 20تا40ثانیه کاهش میابد تا امکان اتصال DNAپلی مراز وپرایمر به DNAالگو که حالت تک رشته ای است فراهم آورد. چون درپرایمرها توالی نوکلئوتیدی کوتاه تری وجوددارد دراین مرحله پرایمرها سریع تر ازرشته دیگر DNAبه آن می چسبد.به طورمعمول درجه حرارت اتصال 3تا5درجه کمتراز درجه حرارت ذوب شدن پرایمر استفاده می شود .هم چنین حساسیت پرایمرها برای چسبیدن به توالی نوکلئوتیدی DNAتک رشته ای پایین است.
3-extension:این مرحله اساسی ترین مرحله است زیرا فعالیت آنزیم شروع میشود . درجه حرارت این مرحله بسته به درجه حرارت آنزیم پلی مراز میباشد. دراین مرحله آنزیم پلی مراز نوکلئوتیدهای مکمل رابراساس رشته الگو درکنار هم قرارداده ودر نهایت رشته مکمل رشته الگوی اولیه راتولید می کند. مدت زمان این مرحله به پلی مرازوطول رشته DNAالگوبستگی دارد.
محصول pcrعبارت است ازقطعه ی همانندسازی شده ای که دوطرف این قطعه سکانس پرایمرها وجود دارند.
به طورمعمول هر عمل pcrبه 20تا40سیکل نیاز دارد.درپایان هرسیکل تعداد نسخه هایی که ازژن ساخته میشود زیاد میشود به طور کلی پس از nسیکل مادر محلول n2نسخه ازژن موردنظرخواهیم داشت.تعدادDNAهای کوتاه (رشته هایی که بین دو پرایمر محصورهستند)به صورت تصاعدی وDNAهای بلند یعنی رشته های که از یک طرف توسط یک پرایمر محدود هستند وازسمت دیگر نامحدود میباشند به صورت تصاعد حسابی زیاد میشوند.
کاربردهای pcr:
به طورکلی pcrبه دومنظور اصلی به کاربرده میشود:1-تهیه نسخه های متعدد:مانند تعیین میزان کراسینگ اور –تعیین فاصله بین ژنها-بررسی پیوستگی ژنهاو...اشاره کرد.
2- بررسی حضوریاعدم حضور یک ژن خاص دریک قطعه DNA:مانندتشخیص بیماریهای ژنتیکی قبل ازتولد-تعیین جنسیت جنین-بررسی عفونت های باکتریایی و ویروسی –تشخیص جهش ها وسرطان هاو...
پایان
امیدوارم این مطالب تونسته باشه اطلاعات خوبی در مورد این تکنیک دراختیارتون گذاشته باشه خوشحال میشم اگه نظراتونو برام بفرستید -مرسی
+ نوشته شده در ۱۳۸۸/۰۷/۱۳ ساعت 17:54 توسط المیرا
|